网络图在许多研究调控关系的文章中非常常见，其通过可视化不同节点间的关联方向及关联程度，更直观展示当中的调控关系。
在《kegg通路背后的网络关系以及核心通路》 一文中介绍了kegg通路之间也存在相互关系。通过kegg网络图，可以一目了然地看到哪些通路是处于核心位置的，与多个通路存在连通关系等信息。
核心35个通路关系的kegg网络图
绘制kegg网络图可以使用Cytoscape等进行操作。在基迪奥OmicShare Tools“kegg高级网络图”工具中，也可以轻松完成，零基础的用户也可以绘制精美的kegg网络图，并且进行个性化的调整。
工具链接：
https://www.omicshare.com/tools/home/report/kegg_senior_network.html
使用kegg高级网络图绘制就非常简单了，只需要根据说明整理好通路文件、通路与基因关系文件（选填）上传即可。具体操作步骤可参考《网络图呈现通路间、通路与基因的关系，我看看谁还不会 》一文。
提交后生成的初始结果图如下：
紫色点为通路、粉色点则为基因，可以看出通路与通路，基因与通路间的连通关系。
可以通过图形设置对kegg网络图整体布局进行转换。
也可以直接鼠标对目标点进行拖动，调整到合适的位置。
打开“补充连接通路”即可把两个kegg通路间连在一起的通路补充在网络图中，以体现间接关系（下图灰色部分）：
打开“补充所有相邻通路”即可把两个kegg通路相邻的所有通路补充：
连接通路及相邻通路补充后，网络图连线、节点会增加，看出来会相对复杂，可以根据实际需求进行调整。
图中的节点我们也可以根据基因数目、FDR值等参数，进行样式及颜色的调整。
以及对关键点单独进行样式的调整：
最后点击下载，还有3种格式（jpg\png\pdf）任君选择~！
使用kegg高级网络图就可以轻松拿捏通路间及通路与基因的关系啦，是不是非常方便~~！
另外，使用KEGG富集分析工具完成富集分析，结果同样会输出kegg网络图哦，完成后点击“预览”即可进入kegg网络图调整、下载界面！
工具链接：https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/pathwaygseasenior
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