女性乳腺癌与基因多态性关联的数据挖掘.pdf
摘要
摘要
研究统计表明,截止二零二零年,乳腺癌已发展成为危及女性身心健康的
最大杀手,尤其是在我国,女性乳腺癌发病群体的数量已经达到了四百五十七
万例,占全球病例的百分之十六,因此它已经成为了一种常见的癌症类型。在
临床上,乳腺癌一般被细分为四种类型,且根据不同的类型有不同的治疗方式,
LuminalA和LuminalB型一般采用的是内分泌治疗,HER-2型往往通过手术治
疗和HER-2靶向治疗,但是对于TNBC型来讲,目前还没有有效的治疗手段。
虽然说针对不同类型的乳腺癌大致已经有了相应的治疗方案,但是对女性乳腺
癌的探索并不会停止。其实在众多的癌症患病因素里,对基因的讨论是不可缺
少的,因为它是遗传物质的基本单位,只有在癌基因被“激活”后才会罹患肿
瘤。
基于此,本文从两个方面来展开讨论,第一,女性乳腺癌与基因多态性的
关系,第二,四种乳腺癌分型与基因多态性的关系。根据数据挖掘的一般步骤,
首先对样本数据进行描述分析,并依据分析结果提出其与基因多态性相关的猜
想,然后以相关性检验为辅、统计建模为主来证实该猜想。
结果表明Group_Lasso、Group_SCAD、Group_MCP为代表的组变量选择模
型对于多分类变量具有良好的解释性能和预测性能。最后通过预测性能较好的
模型的估计参数得出了如下女性乳腺癌与基因多态性关联的结论:TP53(肿瘤
蛋白P53)r(TC)、MTHFR(亚甲基四氢叶酸还原酶)rs1801133
(GA)和rs4846048(AG)、MTR(蛋氨酸合成酶)rs1805087(GA)、
MyD88(髓样分化因子88)rs7744(GA)的多态性以及以rs1801133-r
交互作用出现的成对基因位点中的A-AG、AG-G和A-G基因型对跟女性乳腺癌
的患病相关,其中,r上携带的CT基因型、rs1801133上携带的A基
因型的患者更容易患LuminalA型乳腺癌,除此之外,蛋氨酸合成酶还原酶
rs1801394(AG)、氯离子通道-6rs3737964(CT)的多态性以及以
rs1801133-r互作用出现的成对基因位点中的基因型对为A-G的患者
也会增加患LuminalA型乳腺癌的风险;MTHFR(亚甲基四氢叶酸还原酶)
r(GA)和rs9651118(CT)的多态性与患者患LuminalB型乳腺癌
I
摘要
有关;MyD88(髓样分化因子88)rs7744上携带A基因型的患者更容易患TNBC
型乳腺癌,最后,在27个基因位点中没有与患者患HER-2型乳腺癌相关的基因
多态性的表现。
关键词:女性乳腺癌;基因多态性;数据挖掘;变量选择
II
Abstract
Abstract
Researchshowsthatby2020,breastcancerhasbecomethebiggestkillerof
womensphysicalandmentalhealth.EspeciallyinChina,thenumberoffemalebreast
cancerhasreached4.57million,accountingfor16%oftheglobal.Soithasbecomea
commoncancer.Clinically,breastcancerisgenerallysubdividedintofourtypes,and
therearedifferenttreatmentmethodsaccordingtodifferenttypes.LuminalAand
LuminalBaregenerallytreatedwithendocrinetherapy,whil
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